CAP3 是由 PRABI-Doua（Pôle Rhône-Alpes de Bioinformatique Site Doua）提供网页入口的 DNA 序列组装程序。官网说明，这个表单可以使用 CAP3 程序，将一组连续序列（contigs）进行组装。页面同时提供了 CAP3 的引用要求，并指出如果需要更高级的使用方式，建议将原始软件安装到本地计算机。官网正文没有进一步说明输入文件格式、输出文件格式、账号要求、运行限制或价格信息，因此这里仅依据页面已明确展示的能力介绍其用途。
核心功能
连续序列组装
CAP3 的核心用途是组装一组 contigs。用户可以通过官网提供的表单提交这类序列数据，并使用 CAP3 程序完成序列组装。页面将该功能直接表述为“assemble a set of contiguous sequences (contigs)”。
网页表单入口
PRABI-Doua 页面提供了一个用于运行 CAP3 的表单入口。官网正文确认该表单可调用 CAP3 程序，但没有说明表单支持的具体上传方式、参数数量、文件大小限制或结果页面形式。
CAP3 程序支持
该页面使用 CAP3 作为实际的序列组装程序，而不是仅提供一般性的序列处理说明。CAP3 的完整名称为“CAP3 Sequence Assembly Program”，官网将其定位为用于 DNA 序列组装的程序，并链接到 CAP3 的相关页面。
论文引用信息
如果在已发表的研究工作中使用 CAP3，官网要求引用 Huang 和 Madan 于 1999 年发表的论文《CAP3: A DNA sequence assembly program》。页面给出了该论文的期刊、卷期和页码信息：Genome Research，9，868–877。
本地安装建议
对于更高级的 CAP3 使用方式，官网建议将原始软件安装到本地计算机。网页表单适合直接使用页面提供的组装入口；需要更高级使用时，官方建议转向原始软件的本地安装。页面没有列出本地软件的安装步骤或系统要求。
使用方式
官网提供的是 PRABI-Doua 网站上的 CAP3 在线表单，用于组装一组 contigs。页面没有说明是否需要注册、是否需要自备软件密钥、支持哪些导入与导出格式，也没有在正文中描述 API、命令行或独立客户端。对于更高级的使用方式，官网建议在本地计算机安装原始 CAP3 软件。
适用人群与场景
该工具面向需要进行 DNA 序列组装的研究人员或生物信息学使用者，可用于将一组连续序列（contigs）交由 CAP3 程序处理。使用 CAP3 形成研究成果并发表论文的用户，还需要按照官网给出的信息引用 Huang 和 Madan 的 CAP3 论文。需要更高级控制方式的用户，则可按照官网建议安装原始软件到本地计算机。
注意事项
官网明确要求：如果在发表的工作中使用 CAP3，应引用指定论文。页面还提示，高级使用场景建议安装原始软件；但没有提供在线表单的参数限制、数据保存政策、运行时间或输出结果说明。
